Bandara Corfu memiliki satu terminal kecil yang hanya memiliki satu lantai dasar.
Aula keberangkatan terletak di sisi kiri bangunan (jika dilihat dari luar), sedangkan area kedatangan berada di sisi paling kanan. Selama musim panas, terminal ini memiliki kapasitas di bawah jumlah penerbangan dan terdapat kekurangan tempat duduk serta antrian yang lebih panjang untuk pemeriksaan keamanan (hingga 30 menit).
Terminal ini buka 24 jam sehari.
Transfer antar penerbangan
Corfu bukan merupakan pusat transfer utama sehingga tidak ada pilihan transfer langsung melalui zona transit.
Jika Anda berencana untuk transfer sendiri, Anda harus selalu keluar dari zona transit, check-in lagi dan melalui keamanan kembali.